Флора Кавказского Биосферного Заповедника содержит более 3000 видов растений, 55 из которых занесены в Красную Книгу. Более того, практически каждое пятое растение, встречающееся на территории экосистемы, является реликтовым или эндемиком - представителем флоры, который обитает на ограниченном ареале. Особенного внимания заслуживают прекрасные орхидеи, встречающиеся на просторах заповедника: более 30 видов этих цветов разместились на территории природного комплекса. Разнообразие папоротниковых (более 40 видов растений) представляет огромную ценность для экосистемы.
Лиственные и хвойные леса Кавказа содержат более 900 видов деревьев, внушительная часть которых также является реликтовыми. Благодаря разнообразию почвы и рельефа, на просторах заповедника отлично уживается такое изобилие растений, деревьев и множество представителей фауны.
Животный мир экосистемы содержит более 89 видов млекопитающих и 248 видов птиц. В 1919 году, с целью охраны исчезающего кавказского зубра, лесничий Белореченского лесничества Войска Кубанского, Христофор Георгиевич Шапошников, добился создания Кавказского зубрового заповедника, в организации которого участвовал лично. Спустя некоторое время, Кавказский Биосферный Заповедник стал преемником зубрового, и только в 2008 году ему было присвоено имя Х. Г. Шапошникова.
На территории заповедника могут находиться туристы по пропуску, однако строго запрещается разведение костров, а также нанесение какого-либо ущерба флоре и фауне.
